Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HOMER2Q9NSB8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HOMER2Q9NSB8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms