Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX4

PHPT1, 14 kDa phosphohistidine phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHPT1Q9NRX4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHPT1Q9NRX4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHPT1Q9NRX4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHPT1Q9NRX4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHPT1Q9NRX4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHPT1Q9NRX4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHPT1Q9NRX4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHPT1Q9NRX4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHPT1Q9NRX4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHPT1Q9NRX4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHPT1Q9NRX4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHPT1Q9NRX4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms