Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RAB6BQ9NRW1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB6BQ9NRW1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms