Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FBXO8Q9NRD0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FBXO8Q9NRD0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms