Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR00

C8orf4, Protein C8orf4, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf4Q9NR00 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
C8orf4Q9NR00 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
C8orf4Q9NR00 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms