Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CNGB3Q9NQW8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNGB3Q9NQW8 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNGB3Q9NQW8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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