Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQH7

XPNPEP3, Probable Xaa-Pro aminopeptidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPNPEP3Q9NQH7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
XPNPEP3Q9NQH7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
XPNPEP3Q9NQH7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
XPNPEP3Q9NQH7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms