Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG7

HPS4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS4Q9NQG7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HPS4Q9NQG7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HPS4Q9NQG7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms