Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SEMA4BQ9NPR2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SEMA4BQ9NPR2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms