Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP08

HMX1, Homeobox protein HMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX1Q9NP08 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HMX1Q9NP08 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HMX1Q9NP08 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms