Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM8AQ9HCN3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM8AQ9HCN3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms