Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCL2

GPAM, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAMQ9HCL2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAMQ9HCL2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAMQ9HCL2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAMQ9HCL2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAMQ9HCL2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAMQ9HCL2 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GPAMQ9HCL2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAMQ9HCL2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAMQ9HCL2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAMQ9HCL2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAMQ9HCL2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GPAMQ9HCL2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GPAMQ9HCL2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms