Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
VAT1LQ9HCJ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VAT1LQ9HCJ6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VAT1LQ9HCJ6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms