Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCF6

TRPM3, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM3Q9HCF6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
TRPM3Q9HCF6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TRPM3Q9HCF6 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TRPM3Q9HCF6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms