Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NOD2Q9HC29 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOD2Q9HC29 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms