Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPCSQ9HAB8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms