Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ELP3Q9H9T3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ELP3Q9H9T3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ELP3Q9H9T3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ELP3Q9H9T3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ELP3Q9H9T3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms