Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SMYD3Q9H7B4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SMYD3Q9H7B4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms