Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CCDC8Q9H0W5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC8Q9H0W5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms