Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Q0

FAM49A, Protein FAM49A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49AQ9H0Q0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FAM49AQ9H0Q0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FAM49AQ9H0Q0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms