Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR1EQ9GZS1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
POLR1EQ9GZS1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms