Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
PDGFDQ9GZP0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDGFDQ9GZP0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms