Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
LNPKQ9C0E8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LNPKQ9C0E8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms