Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRCC1Q9C099 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRCC1Q9C099 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRCC1Q9C099 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms