Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
IFIH1Q9BYX4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFIH1Q9BYX4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms