Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
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KRTAP9-3Q9BYQ3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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KRTAP9-3Q9BYQ3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
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KRTAP9-3Q9BYQ3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
KRTAP9-3Q9BYQ3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC9.81□□□□□ -0.84
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