Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
RNF17Q9BXT8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RNF17Q9BXT8 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RNF17Q9BXT8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RNF17Q9BXT8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
RNF17Q9BXT8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RNF17Q9BXT8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
RNF17Q9BXT8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
RNF17Q9BXT8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RNF17Q9BXT8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
RNF17Q9BXT8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RNF17Q9BXT8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC31.64■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
RNF17Q9BXT8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms