Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PLVAPQ9BX97 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PLVAPQ9BX97 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PLVAPQ9BX97 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms