Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH6

RPAP1, RNA polymerase II-associated protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP1Q9BWH6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPAP1Q9BWH6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RPAP1Q9BWH6 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms