Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
HIRIP3Q9BW71 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
HIRIP3Q9BW71 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms