Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFAF3Q9BU61 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms