Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
NDC1Q9BTX1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
NDC1Q9BTX1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms