Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSJ2

TUBGCP2, Gamma-tubulin complex component 2, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP2Q9BSJ2 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TUBGCP2Q9BSJ2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TUBGCP2Q9BSJ2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 450.6 ms