Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAAF1Q9BRP4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms