Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM2D3Q9BRN9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM2D3Q9BRN9 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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