Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SEC22CQ9BRL7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SEC22CQ9BRL7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms