Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC77Q9BR77 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC77Q9BR77 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC77Q9BR77 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms