Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RHOXF2Q9BQY4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RHOXF2Q9BQY4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms