Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
EBF4Q9BQW3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
EBF4Q9BQW3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms