Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BPIFA3Q9BQP9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BPIFA3Q9BQP9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms