Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQN1

FAM83C, Protein FAM83C, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM83CQ9BQN1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM83CQ9BQN1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM83CQ9BQN1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM83CQ9BQN1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM83CQ9BQN1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms