Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PMCHL2Q9BQD1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms