Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHDC3Q9BQ90 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHDC3Q9BQ90 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms