Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCF25Q9BQ70 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF25Q9BQ70 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 246.4 ms