Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KCNS3Q9BQ31 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KCNS3Q9BQ31 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms