Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CITED1Q99966 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CITED1Q99966 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms