Protein–RNA interactions for Protein: Q99836

MYD88, Myeloid differentiation primary response protein MyD88, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYD88Q99836 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYD88Q99836 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYD88Q99836 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms