Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAD9AQ99638 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RAD9AQ99638 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms