Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CPXM1Q96SM3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CPXM1Q96SM3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms