Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TSPAN18Q96SJ8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TSPAN18Q96SJ8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms